第一話「蒼穹作戦」

人類とフェストゥムとの戦いは、さらに複雑さを増しながら続いていた。

「第五次蒼穹作戦」の名の元、奪われた同胞を取り戻すため
人型兵器ファフナーに乗り込んだ真壁一騎ら竜宮島部隊はフェストゥムとの激しい戦闘を繰り広げる。

「誰かが生きるために誰かが犠牲になる。そんな世界を捨てて生きよう。」
「お前を、居るべき場所へ還す」

奪われたのは竜宮島の人々にとって、かけがえのない存在。
だがそれは、拮抗するものたちにとっても同じこと。そして、人類にとっても……。

終わりの見えない戦いが続く世界。
そして、ここに今、また新たな物語が始まる――